بنيصدر در روز دوشنبه ۱۵ بهمنماه ۱۳۵۸ کار خود را به عنوان اولين رئيس جمهور ايران آغاز کرد؛ اين درحالي است که وي در روز یکشنبه ۳۱ خرداد ماه سال ۱۳۶۰، توسط پارلمان (مجلس شورای اسلامی) و نهایتاً تأیید امام(ره) به دلیل عدم کفایت سیاسی، از مقام خود عزل شد.
دوران ریاست جمهوری او با حاشیههای فراوان برای انقلاب اسلامی همراه بود که مهمترین آن انتخاب نخست وزیر، درگیری با حزب جمهوری اسلامی، مجلس و فرماندهی جنگ، بود.
اعضای کابینه بنی صدر:
نخست وزیر: محمدعلی رجایی
وزارت کشاورزی: محمد سلامتی
وزارت آموزش و پرورش: محمدجواد باهنر
وزارت بهداشت: هادي منافی
وزارت اقتصاد و دارایی: حسين نمازي
وزارت دادگستری: ابراهيم احدی
وزارتخارجه: میر حسین موسوی
وزارت دفاع: جواد فکوری
وزارت بازرگانی: کاظم پور اردبیلی
وزارت راه: موسی کلانتری
وزارت صنایع: محمد رضا نعمت زاده
وزارت فرهنگ و آموزش عالي:حسن عارفی
وزارت ارشاد: عباس دوزدوزانی
وزارت کار و امو اجتماعي: میر محمد صادقی
وزارت کشور: مهدوی کنی
وزارت مسکن: محمد شهاب گناآبادی
وزارت نفت: جواد تندگویان
وزارت نیرو: حسن عباسپور